Di rumah Ivan Petrovich Shuisky, di hadapan banyak paderi dan beberapa boyar, mereka memutuskan untuk menceraikan Fyodor Ioannovich dengan tsarina, saudara perempuan Godunova, terima kasih kepada siapa, oleh semua akaun, Boris disimpan. Mereka membuat sebuah kertas, di mana, mengingat keganasan ratu dan masa kecil Demetrius, mereka meminta raja untuk mengadakan pernikahan baru. Golovin memberi isyarat kepada Shuisky tentang kemungkinan meletakkan Demetrius sebagai pengganti Fedor, tetapi menerima teguran keras. Puteri Mstislavskaya membawa tetamu berkeliling, minum kesihatan Fedor. Shakhovsky, pengantin lelaki Mstislavskaya, jodoh Volokhov memanggil tempat pertemuan rahsia. Ivan Petrovich mengirimkan petisi kepada Metropolitan, yang menyesalkan perlunya menghancurkan ratu. Fedyuk Starkov, pelayannya, melaporkan apa yang telah dilihat oleh Godunov. Setelah mendapat maklumat dari Uglich mengenai hubungan Golovin dengan Nagimi dan melihat ancaman terhadap kekuasaannya, dia mengumumkan kepada para penyokongnya, Lup-Kleshnin dan Putera Turenin, keputusan untuk berdamai dengan Shuisky. Fyodor tiba, mengadu tentang kuda yang dipukul. Tsarina Irina muncul, yang Fedor salah melaporkan tentang kecantikan Mstislavskaya, yang dilihatnya di gereja, dan segera memberi jaminan kepada Tsarina bahawa dia lebih cantik baginya daripada orang lain. Godunov berbicara tentang keinginan untuk berdamai dengan Shuisky, dan tsar dengan senang hati menerima masalah itu.
Fedor mengumumkan niatnya untuk mendamaikan Godunov dengan Shuisky dan meminta pertolongan dari Metropolitan Dionysius dan paderi lain. Dionysius menuduh Godunov menindas gereja, bersikap lemah lembut dan meneruskan pengumpulan cukai, dari mana gereja itu dibebaskan. Godunov memberinya surat pelindung dan laporan mengenai penganiayaan terhadap ajaran sesat yang dilakukan. Raja meminta sokongan dari Irina dan boyar. Diiringi oleh semangat popular, Ivan Petrovich Shuisky datang. Fedor mencela dia kerana tidak mengunjungi Duma, Shuisky berkecil hati dengan kemustahilan untuk memberi izin kepada Godunov. Fyodor, mengingat Kitab Suci dan memanggil pendeta untuk menjadi saksi, berbicara tentang faedah pendamaian, dan Godunov, yang taat kepadanya, memberikan persetujuan Shuisky. Shuisky mencela dia kerana tidak mahu berkongsi kawalan negara, yang diwariskan oleh John kepada lima boyar: Zakharyin (meninggal), Mstislavsky (dipaksa kuat), Belsky (diasingkan), Godunov dan Shuisky. Godunov, membenarkan dirinya, berbicara tentang kesombongan Shuisky, bahawa dia menggunakan satu-satunya kekuatan untuk kepentingan Rusia, yang juga dibuktikan oleh; dia menambah bahawa tugas yang sukar untuk mengatur keadaan yang kecewa hanyalah Shuysky. Dan ketika Ivan Petrovich memanggil penyokongnya Metropolitan, dia melaporkan tindakan Godunov yang memihak kepada gereja dan meyakinkan Shuisky untuk berdamai. Irina, menunjukkan sampul bersulamnya untuk kuil Pskov, mengakui bahawa ini adalah sumpah doanya untuk keselamatan Shuisky, yang pernah dikepung oleh orang Lithuania di Pskov. Shuisky yang bersemangat bersedia melupakan permusuhannya yang dulu, tetapi tuntutan jaminan keselamatan Godunov untuk rakan sekerjanya. Godunov bersumpah dan mencium salib. Mereka mengundang orang terpilih dari orang ramai yang dibawa oleh Shuisky. Fyodor bercakap dengan lelaki tua itu dan tidak tahu bagaimana untuk menghentikannya, di dalam keponakannya dia mengenali saudagar Krasilnikov, yang menghiburkannya baru-baru ini dengan pertengkaran beruang, mengenang saudaranya Golub, yang mengalahkan Shakhovsky dalam keadaan kelam - Godunov dan Shuisky tidak segera berjaya mengembalikan tsar kepada pemilih yang diminta. . Shuisky mengumumkan perdamaian dengan Godunov, para pedagang khawatir ("Anda mendamaikan kepala kami"), Shuisky kesal dengan ketidakpercayaannya terhadap orang yang baru saja bersumpah di kayu salib. Pedagang meminta perlindungan dari Godunov, raja, tetapi dia menghantar mereka ke Boris. Boris diam-diam memerintahkan untuk menuliskan nama peniaga.
Pada waktu malam di taman Shuysky Princess Mstislavskaya dan Vasilisa Volokhova menunggu Shakhovsky. Dia datang, bercakap tentang cinta, tentang ketidaksabaran yang menantinya, menertawakannya dan bergurau dengannya. Krasilnikov berlari, membiarkan, Shakhovsky bersembunyi, memanggil Ivan Petrovich dan melaporkan bahawa setiap orang yang bersama tsar itu ditangkap atas perintah Godunov. Shuisky yang terkejut memerintahkan Moscow untuk naik ke Godunov. Dia mengisyaratkan Dimitri Golovin secara tiba-tiba memutuskan diri dan, mengatakan bahwa Boris telah menipu dirinya sendiri, dia pergi ke tsar. Sementara itu, boyar yang masih ada, sedang membincangkan petisyen itu, mencari ratu baru. Vasily Shuisky memanggil Puteri Mstislavskaya. Kakaknya tidak segera memutuskan, ingin mencari sekurang-kurangnya alasan untuk bertengkar dengan Shakhovsky. Walaupun dia ragu-ragu, Golovin menulis nama puteri menjadi petisyen. Shakhovskaya muncul, menyatakan bahawa dia tidak akan melepaskan pengantin perempuan. Puteri dan Volokhova juga dijumpai. Dengan tangisan umum, saling mengancam dan mencela, Shakhovskaya mengambil sepucuk surat dan melarikan diri. Godunov membentangkan kepada surat kabar negara tsar, yang isi kandungannya tidak dimilikinya, tetapi bersetuju dengan keputusan Boris. Tsarina Irina berbicara mengenai sepucuk surat dari Uglich dari Ratu Dowager dengan permintaan untuk kembali bersama Dimitri ke Moscow. Fyodor menyerahkan kes itu kepada Boris, tetapi Irina menuntut penyelesaian "urusan keluarga" darinya; Fedor berdebat dengan Boris dan kesal dengan kegigihannya. Shuisky datang, mengadu tentang Godunov. Dia tidak membuka kunci, menjelaskan bahawa pedagang itu tidak diambil untuk masa lalu, tetapi kerana cuba mengecewakan dunia antara dia dan Shuisky. Tsar siap memaafkan Godunov, percaya bahawa mereka tidak saling memahami, tetapi permintaan tanpa henti untuk meninggalkan putera di Uglich akhirnya marah dengan tsar. Godunov mengatakan bahawa dia memberi jalan kepada Shuisky, Fedor meminta dia untuk tinggal, Shuisky, terluka oleh tingkah laku tsar, pergi. Kleshnin membawa surat Golovin Nagim yang dikirim dari Uglich, Godunov menunjukkannya kepada tsar, menuntut agar Shuisky ditahan dan, mungkin, dilaksanakan. Sekiranya gagal, dia mengancam untuk pergi. Fedor terkejut setelah lama ragu-ragu menolak layanan Godunov.
Ivan Petrovich Shuisky menghiburkan Puteri Mstislavskaya: dia tidak akan membiarkannya berkahwin dengan tsar dan berharap agar Shakhovskaya tidak memberitahu mereka. Setelah mengirim puteri, dia menerima boyar dan buronan Krasilnikov dan Dove, dan, dengan menganggap penyingkiran Fedor yang miskin dan penaklukan Demetrius, menentukan tugas setiap orang. Godunov yang terasing, duduk di rumah, bertanya kepada Kleshnin mengenai Volokhova dan berulang kali, "sehingga dia akan memikat putera itu". Kleshnin mengirim Volokhov kepada UGLICH seorang ibu baru, memerintahkannya untuk dilindungi, dan mengisyaratkan bahawa jika putera yang menderita padi akan bunuh diri, mereka tidak akan memintanya. Sementara itu, Fedor tidak dapat mengetahui kertas kerja yang dikemukakan kepadanya. Kleshnin tiba dan melaporkan bahawa Boris jatuh sakit kerana kecewa, dan Shuisky harus segera dipenjarakan kerana niatnya untuk mengangkat Demetrius ke takhta. Fedor tidak percaya. Shuisky masuk, kepada siapa Fedor berbicara tentang pengecaman dan memintanya untuk membenarkan dirinya sendiri. Putera menolak, raja menegaskan, Kleshnin mendorong. Shuisky mengaku pemberontakan. Fyodor, ketakutan bahawa Godunov akan menghukum Shuisky kerana pengkhianatan, menyatakan bahawa dia sendiri memerintahkan untuk meletakkan putera itu di takhta, dan memaksa Shuisky yang terkejut dari ruangan itu. Shakhovskaya menerobos masuk ke kamar raja dan meminta untuk mengembalikan pengantin perempuan kepadanya. Fedor, setelah melihat tanda tangan Ivan Petrovich Shuisky, menangis dan tidak mendengar hujah Irina mengenai kelewatan makalah itu. Melindungi Irina dari penghinaan, dia menandatangani perintah Borisov, menakutkan dia dan Shakhovsky. Di jambatan di atas sungai, lelaki tua itu merusuh orang-orang untuk Shuisky, si hussar bernyanyi tentang keberaniannya. Seorang utusan menunggang dengan berita tentang kemajuan Tatar. Putera Turenin bersama pemanah membawa Shuisky ke penjara. Orang-orang yang dipukul oleh orang tua itu ingin membebaskan Shuisky, tetapi dia berbicara tentang rasa bersalahnya di hadapan raja yang "suci" dan bahawa mereka berhak mendapat hukuman.
Kleshnin melaporkan kepada Godunov bahawa Shuiskys dan penyokongnya dipenjarakan dan memperkenalkan Vasily Ivanovich Shuisky. Dia mengubah perkara itu seolah-olah dia telah memulai petisi untuk kebaikan Godunov. Memahami bahawa Shuisky ada di tangannya, Godunov membiarkannya pergi. Tsarina Irina datang untuk memberi syafaat kepada Ivan Petrovich. Godunov, menyedari bahawa Shuisky tidak akan berhenti berdebat dengannya, bersikeras. Di alun-alun di depan katedral, pengemis berbicara tentang perubahan metropolitan yang tidak menyenangkan Godunov, mengenai pelaksanaan pedagang yang berdiri di belakang Shuisky. Tsarina Irina memimpin Mstislavskaya untuk meminta Shuisky. Fedor keluar dari katedral, setelah memenuhi syarat untuk Tsar Ivan. Puteri meluru berdiri. Fedor menghantar Putera Turenin untuk Shuisky. Tetapi Turenin melaporkan bahawa Shuisky mencekik dirinya sendiri pada waktu malam, menyalahkan dirinya kerana mengabaikan (kerana dia memukul orang banyak yang dibawa ke penjara oleh Shakhovsky, dan memukul hanya dengan menembak Shakhovsky). Fedor meluru ke arah Turenin, menuduhnya membunuh Shuisky, dan mengancamnya dengan hukuman mati. Utusan itu membawa sepucuk surat dari Uglich mengenai kematian putera itu. Raja yang terkejut ingin mengetahui kebenarannya sendiri. Ada pesan mengenai pendekatan Khan dan pengepungan awal Moscow. Godunov menawarkan untuk menghantar Kleshnin dan Vasily Shuisky, dan Fedor yakin dengan Godunov tidak bersalah. Puteri Mstislavskaya mengatakan bahawa dia berhasrat untuk memotong rambutnya. Fyodor, atas nasihat isterinya, akan menyerahkan seluruh beban pemerintahan kepada Boris dan, mengingat niatnya untuk "menyetujui semuanya, melancarkan semuanya", meratapi nasib dan tugas kerajaannya.
